合理选择和把握跟踪时机。政策跟踪审计不同于一般项目的跟踪，它是有阶段性的，每一个阶段都会有一个适当跟踪时机的选择问题。通常在政策执行的转折时期，如从无到有的试点日期，从点到面的政策推进期，政策普及后的成熟稳定期，都容易出现各种管理漏洞，各种形式的营私舞弊甚至腐败行为也会趁虚而入，这时就更需要国家审计机关及时介入，加强审计监督。
　　加强审计专家队伍建设。政策跟踪审计涉及政治价值、经济运行、人口增长、社会结构变迁等诸多影响因素，审计人员必须增加政治学、经济学、社会学、社会保障学、公共管理学、政策科学等学科知识的学习，从多学科交叉的视角进行政策执行情况分析。在审计人员配备和审计专家的任用上，必须突破传统借助外聘专家意见的局限。因此，只有培养审计机关自身的专家型审计专业人才，在审计实践中才能发挥多学科优势，对政策执行情况进行综合评价与分析，从而提高审计结论的科学性和准确性。然而，在较短时间内无法改变当前审计人才知识结构单一问题的情况下，合理配置现有的审计人力资源，是进一步提升政策跟踪审计质量的关键环节，它直接影响着跟踪审计的实施效果。